JD Byg har eksisteret siden 1996, hvor Henrik Daugaard etablerede virksomheden. Oprindeligt som en traditionel tømrervirksomhed, som dog efterhånden udviklede sig til primært at opføre hele byggesager indenfor hal- og staldbyggeri.
I 2012 blev Rasmus K. Hansen ansat i selskabet, hvorefter Henrik og Rasmus dannede JD Byg Entreprise. De fik i fællesskab udviklet selskabet, fra en tømrervirksomhed til et selskab som udførte byggeopgaver i hhv. fag-, hoved- og totalentrepriser.
Gennem årene har selskabet haft stor fokus på erhvervsbyggeri i bred forstand, hvor byggeopgaverne er spredt ud over hele landet.
Selskabet har fortsat en større tømrerafdeling, som dog primært udfører byggeopgaver på egne projekter.
I 2022 solgte Henrik hovedparten af sin ejerandel til Rasmus, og udtrådte af direktionen.
I januar 2023 udnævntes udviklingschef Torben Molme til direktør i selskabet efter næsten 3 års ansættelse.
Direktionen udgør herefter Rasmus K. Hansen og Torben Molme i fællesskab.